单独服用盐酸司来吉兰耐受性好。有报导服用盐酸司来吉兰后病人口干，短暂血清转氨酶值升高及睡眠障碍(例如失眠)的发生率比用安慰剂病人增加。由于盐酸司来吉兰能增加左旋多巴效果，左旋多巴不良反应也会增加。
加入盐酸司来吉兰给已服用最大耐受剂量左旋多巴患者，可能出现不随意运动、恶心、激越、错乱、幻觉、头痛、体位性低血压及眩晕。排尿困难及皮疹也曾有报导。应监测潜在的不良反应。所以，当加入盐酸司来吉兰治疗时，左旋多巴剂量应降低平均百分之三十。有不稳定高血压、心律失常、严重心绞痛或精神病以及前列腺肥大伴排尿困难者服用盐酸司来吉兰片需特别注意。若服用过大剂量（超过每天30毫克），会消失一些抑制单胺氧化酶B受体（MAO-B）的选择性，抑制单胺氧化酶B受体（MAO-B）开始显著增加。
所以，同时服用大剂量盐酸司来吉兰片及高酪胺食品可能引发理论上的高血压症危险，曾报告在盐酸司来吉兰治疗期中有短暂性转氨酶增高。运动员慎用！本品治疗中与间接的拟交感神经药相互作用所引起的高血压反应要留意。治疗帕金森所用的盐酸司来吉兰片剂量与含酪食品同时服用未发现有高血压反应。本品与非选择性单胺氧化酶抑制剂合用可能引起严重低血压。同时与单胺氧化酶A抑制剂吗氯贝胺服用并无耐药问题的报告。但同期用此类药品(MAOA及MAOB抑制剂)及酪胺类物质(例如含酪食品如发酵食品及饮料、芝士、香肠、腌肉类、野味、肝脏、牛肉汤、咸鱼、豆类及豌豆、德国腌菜及酵母制品)会轻度增加高血压反应。但由于本品与吗氯贝胺同时服用文献报导不详，这两种药不能同时服用。
有报告盐酸司来吉兰片与度冷丁有相互作用，由于有些相互作用可致命并且机理未被确定，所以应避免同时服用。
盐酸司来吉兰片与氟西汀同时服用有报告产生严重反应，例如共济失调、震颤、高热、高/低血压、惊厥、心悸、流汗、脸红、眩晕及精神变化（激越、错乱、及幻觉）演变至谵妄及昏迷。由于氟西汀及其代谢产物的半衰期较长，氟西汀停药最少五星期后才开始服用盐酸司来吉兰片。另盐酸司来吉兰片及其代谢产物半衰期短，盐酸司来吉兰片停药两星期后即可开始服用氟西汀。盐酸司来吉兰片与其他两种5-羟色胺重摄取抑制剂舍曲林及帕罗西汀同时服用也有类似报导，并且相互作用机制并不清楚了解，这些药物与盐酸司来吉兰片应避免同时服用。
由于氟西汀及其代谢产物的半衰期较长，氟西汀停药最少五星期后才开始服用盐酸司来吉兰片。另盐酸司来吉兰片及其代谢产物半衰期短，盐酸司来吉兰片停药两星期后即可开始服用氟西汀。在健康志愿者中同时服用盐酸司来吉兰片及西酞普兰无任何临床、药效学或药物动力学的相互作用。不过，同时服用盐酸司来吉兰片及所有选择性5-羟色胺重摄取抑制剂万拉法辛及氟优沙明都要注意。盐酸司来吉兰片及三环类抗抑郁药同用时要小心，曾报告有严重中枢神经症状，有几例出现高热、震颤及激越的死亡报告。其他报告同时服用盐酸司来吉兰片及三环类抗抑郁药的不良反应有高/低血压、眩晕、出汗增加、震颤、抽搐、行为及精神改变。由于相互作用机理尚未清楚，加进这些药物于正服用盐酸司来吉兰片的病人要谨慎。遗传毒性：鼠伤寒沙门菌基因突变试验和体内染色体畸变试验，未见基因突变或染色体损伤。但尚不能确定司来吉兰无致突变或致染色体裂变的作用。
生殖毒性：致畸敏感期试验中，SD大鼠经口给予司来吉兰4、12和36mg/kg(按mg/m2计算，分别相当于人用剂量的4、12、35倍)未观察到致畸作用，但36mg/kg组的胎仔体重降低；新西兰兔经口给药5、25、50mg/kg(按mg/m2计算，分别相当于人用剂量的10、48、95倍)未见致畸作用，但25和50mg/kg组的胎仔数少于致畸作用评价所推荐的胎仔数，50mg/kg组的总吸收胎数和着床后丢失率增加，平均存活胎仔数减少。围产期试验中，SD大鼠经口给予司来吉兰4、16和64mg/kg(按mg/m2计算，分别相当于人用剂量的4、15、62倍)，发现16和64mg/kg组死胎数增加，平均产仔数、存活胎仔数减少，胎仔体重减轻(出生时以及整个哺乳期间)，64mg/kg组出生时的活仔产后4天内就全部死亡，故无法判断此剂量对出生后发育的影响。