内镜室现有日本产欧林巴斯电子胃镜、电子结肠镜、电子支气管镜、电子十二指肠镜，和国内先进的肯格王内镜清洗设备、内镜自动消毒储存柜等先进设备多台。已开展的检查项目有:电子胃镜检查、电子结肠镜检查、电子支气管镜检查、电子十二指肠镜检查。通过内镜下直观诊断，结合内镜下钳取活体组织病理检查，可对消化道，呼吸道的急、慢性炎症、溃疡病，良、恶性肿瘤等疾病作出定位、定性诊断。已开展的内镜治疗项目:上消化道及呼吸道异物内镜下取出术，消化道及呼吸道出血内镜下止血术，消化道及呼吸道息肉内镜下高频氩气烧灼术、摘除术；十二指肠逆行胆管造影术；十二指肠乳头高频电刀切开取石术、引流术；内镜胆管结石取石术、碎石术；内镜下鼻胆管引流术等。