复旦大学附属中山医院放疗科目前由总部与分部两部分组成，总部放疗科成立于1996年，而分部放疗科原属上海市纺织第三医院，有20年的历史。目前总部与分部放疗科合并，更进一步壮大中山医院放疗科的实力，拥有3台直线加速器，2台人体模拟定位机，2台放射治疗计划系统。目前有医生26人，其中副高级以上的医生6名，主治医生8名。物理师2名，技术员18名，病床80张。为复旦大学的硕士点，每年招收放射治疗硕士。

　　复旦大学中山医院放疗科依托综合性大医院的优势，走肿瘤综合治疗之路，与临床各科室密切配合，目前在我科接受放疗病人最多的有肺癌、乳腺癌、脑瘤和肝癌，中山医院放疗科成为上海市重点临床学科肝癌诊治中心的一部分，肝癌的放疗是中山医院放疗科的特色之一。2002年，中山医院放疗科与肺科、胸外科联合成立肺部肿瘤综合治疗中心，使肺癌病人的合理治疗成为可能，目前设在分部的肺癌综合治疗病区有37张床位。中山医院乳腺疾病诊治中心的重点是治疗乳癌的病人，乳腺外科、放疗科、与化疗的密切配合积极开展乳腺癌的保乳治疗，完善乳癌病人的术后综合治疗，目前总部与分部通过保乳治疗乳癌的病人超过200人，疗效颇佳，受到广大病员的普遍欢迎。中山医院放疗科承担大量脑外科的脑肿瘤病人的术后放疗，对中枢神经系统肿瘤的放疗有丰富的临床经验。中山医院腹部外科与泌尿外科每年收治许多的肿瘤病人，中山医院放疗科与腹部外科、泌尿外科密切配合，努力作好直肠癌、胃癌、胰腺癌 膀胱癌、前列腺癌的综合治疗，同样也有专人负责这些肿瘤的放疗。

　　消化道恶性肿瘤的术中放疗是上海市医学领先专业课题，目前已有上百例病例的经验，尤其是胃癌、胰腺癌的术中放疗取得了可喜的成效。中山医院放疗科除了临床医疗外，每年还承担教学与研究，成功举办国家级继续教育项目《肿瘤放射综合治疗进展》（项目编号2004-09-03-010），加强国内外同行的交流。2003年荣获上海市首届医学科技奖，在肝癌的放射治疗基础与临床研究取得良好的结果，在国外英文医学杂志发表9篇关于肝癌放射治疗的论著。

　　中山医院放疗科以中山医院的院训为指导精神，以病人为中心，为国内外的病人提供优质的服务，被评为2000年上海市劳模集体。